Cikkünk a Science X szerkesztői folyamatának és politikáinak megfelelően került átvizsgálásra. A szerkesztők az alábbi jellemzőket emelték ki, miközben biztosították a tartalom megbízhatóságát:
Valóságellenőrzés elvégezve
Peer review folyamatból származó publikáció
megbízható forrás
Nyelvtanilag és szöveg szerkezetileg átdolgozva
A technológia két megközelítés egyesítésével teszi lehetővé, hogy a kutatók a szöveti sejtek térbeli kontextusának megőrzése mellett magasabb szintű kromatimikroarchitektúrát vizsgáljanak. Ez a megközelítések kis folyadékkanalizást használnak a szövet különböző pozícióinak molekuláris azonosítók hozzáadásához, és lehetővé teszik, hogy meghatározzák, hol valósulnak meg a konkrét kromatin kölcsönhatások a mikroáramlási térbeli barkódolással, valamint a SPRITE-szerű ligációmentes érintés-detektálási stratégiával, amely a kromatin régiók közötti kölcsönhatásokat azonosítja anélkül, hogy fizikailag összekötné a DNS darabokat.
A kutatást a című folyóirat publikálta.
A rövid távú kromatin kölcsönhatásokon túl
Az elmúlt években az egysejtes 3D genomikai technológiák előrelépést értek el a kromatin konformáció megértésében. Azonban ezek a módszerek nem tudják megőrizni a sejtek térbeli pozícióját a szöveteken belül, ami nehezíti a genomikai architektúra természetes sejtbeli környezetben történő génkifejeződés-szabályozásának vizsgálatát.
Az utóbbi időben kifejlesztett térbeli 3D genomikai technológiák túlnyomórészt a ligációalapú Hi-C stratégiákat fogadták el, amelyek rövid hatótávolságú, legfeljebb 10 megabázis (Mb) kromatin-interakciókat detektálnak.
Ezeket a korlátmányokat feloldva a kutatók a SpaceA módszert alkalmazták kilenc egér-embrió metszeten, amelyeket a fejlődés négy szakaszára, az E11,5–E14,5 embriyonikus időszakra (E11,5–E14,5) választottak ki, és körülbelül 4 TB mély szekvenálási adatot hoztak létre a kromatin-konformációban bekövetkező változások leírásához az embriyonikus fejlődés során.
A kromatin átrendeződései az embriyonikus fejlődés során
A kutatók SpaceA felhasználásával megállapították, hogy az A/B szegmensek (compartments) E12.5-től E13.5-ig drasztikus változásokon mennek át, és ez a folyamat párhuzamosan zajlik le mély transkriptomikus változásokkal.
Az ekip szintén felfedezett egy új, a klasszikus A/B compartment meghatározástól függetlenül működő, az embriyonikus májban másképp kialakuló kromatinképződési mechanizmust. A közepes távolságú kölcsönhatások (10–40 Mb) jelentősen megnőttek, a szomszédos compartmentok közötti kölcsönhatások megerősödtek, míg a hosszú távolságú, kromozómák közötti kölcsönhatások (>40 Mb) gyengültek.
Mikroszkópos vizsgálatokkal a májsejtek nukleáris heterokromatin-rákódását mutatták ki, ezzel további bizonyítékot szolgáltatva ennek a különleges kromatin-szerveződésnek a meglétéről, amely a génexpresszió globális csökkenésével járt. Ez a mintázat eltér a klasszikus modelltől, amelyben a génexpressziót az A/B-kompartimentek közötti váltás, illetve a kompartimenensen belüli kölcsönhatások hajtják.
Yuang Ma és munkatársai, Térilegesen felbontott genom architektúra az egér embrionális fejlődésben, (2026). DOI: 10.1016/j.devcel.2026.09.004
A Kínai Tudományos Akadémia által biztosított
Swati Mestri elektronikai mérnökség területén diplomával rendelkezik, és 2019 óta tartalom szerkesztőként dolgozik. Tapasztalata van technológiai, egészségügyi és anyagtudományi kutatási dokumentumok szerkesztésében; különösen érdekelik a technológiai és űr témák.
Profil teljes megtekintése →
Matematikai biológia területén alapfokozatot, kreatív írás területén mesterfokozatot szerzett. Egyedi nézőpontokat kínál a tudomány és a nyelv témájában, sokat utazó személyiség. A profil teljes tartalma →
Visszajelzés a szerkesztőknek
Bu gelişme hakkında düşüncelerinizi, donanım deneyimlerinizi veya sorularınızı Community Forumumuzda paylaşın.
Foruma Katıl & Yanıtla ➔
Γίνετε ο πρώτος που θα σχολιάσει
Αναπτύξτε την ιδέα σας με μια πηγή, ερώτηση ή εποικοδομητικό αντεπιχείρημα.