Tek Hücreli DNA Metilasyonu İçin Yeni Analiz Yöntemi Geliştirildi

Msc-RRBS kütüphane hazırlığı ve metilasyon analizinin iş akışı. Kaynak: GU Hongcang

Araştırmacılar, son zamanlarda bireysel hücrelerde DNA metilasyonunu analiz etmek için standartlaştırılmış bir iş akışı geliştirdi. İyileştirilmiş bir laboratuvar prosedürünü otomatikleştirilmiş bir veri analiz aracıyla birleştiren protokol, hücreler arasındaki farkları çalışmayı kolaylaştırıyor. Nature Protocols‘de yayımlanan çalışma, Çin Bilimler Akademisi Hefei Fizik Bilimleri Enstitüsü’nün Sağlık ve Tıp Teknolojileri Enstitüsü’nden araştırmacıların liderliğinde gerçekleştirildi.

DNA metilasyonu, gen aktivitesini düzenlemeye yardımcı olur ve hücre gelişimi ile hastalıklara dahil olur. Geleneksel dizileme, bireysel hücreler arasındaki farkları maskeleyebilecek şekilde çok sayıda hücre üzerinden ortalama metilasyon düzeylerini ölçer. Tek hücreli dizileme bu farkları ortaya çıkarabilir, ancak her hücredeki az miktarda DNA numune hazırlamayı zorlaştırır.

Bu zorluğu aşmak için araştırmacılar, sürecin birkaç adımını basitleştirdi. Hücre hazırlığı, DNA sindirimi ve diğer reaksiyonlar aynı mikrokuyuda gerçekleştirilerek tekrarlı saflaştırma ihtiyacını azaltır ve DNA kaybını önlemeye yardımcı olur. Moleküler kodlar bireysel numuneleri etiketlerek 24 tek hücreli numunenin işlenmek üzere birleştirilmesine olanak tanır. Bu da reaktif kullanımını azaltır ve süreci daha verimli kılar.

Araştırmacılar ayrıca dizileme verilerini işleyen, metilasyon kalıplarını belirleyen ve veri kalitesini kontrol eden SingleCellMethPipe adlı otomatikleştirilmiş bir analiz aracı geliştirdi.

Yöntemi değerlendirmek için araştırmacılar, sağlıklı bir bağışçıdan ve sağlıklı kan hücrelerinin üretimini etkileyen bir bozukluk olan myelodisplastik sendromu olan bir hastadan 96 bireysel kan yapan kök ve ön hücreyi analiz etti.

Bunların 86’sı kalite kontrollerinden geçti ve bu da %89,6’lık bir başarı oranı verdi. Analiz, hücre tipleri arasında ve sağlıklı ile hastalı numuneler arasında DNA metilasyon farklarını ortaya çıkardı.

Araştırmacılara göre protokol, hücrelerin nasıl geliştiğini ve DNA metilasyonundaki değişikliklerin kan hastalıkları ve kanserle nasıl ilişkili olduğunu çalışmak için pratik bir araç sağlıyor.

Fang Liu ve ark., Multiplexed single-cell reduced representation bisulfite sequencing for genome-wide DNA methylation profiling, Nature Protocols (2026). DOI: 10.1038/s41596-026-01452-9

Dergi Bilgileri:
Nature Protocols

DNA dizileme
Bioformatiği
Numune hazırlığı

Çin Bilimler Akademisi

Hikayenin Arkasındaki Kişiler:

BA sanat tarihi, MA malzeme kültürü. Eski müze editörü, paramedik ve organ nakil koordinatörü. 2021’den beri Science X için düzenleme yapıyor.

Full profile →

Fizik alanında yüksek lisans, araştırma deneyimi. Uzun süredir bilim haberleri meraklısı. Science X’in editöryal başarısında anahtar rol oynuyor.

Full profile →

Atıf

:
Araştırmacılar tek hücreli DNA metilasyonu analizi için yöntem geliştirdi (2026, 3 Kasım)
3 Kasım 2026’da retrieved
from https://phys.org/news/2026-11-method-cell-dna-methylation-analysis.html

Bu belge telif hakkına tabidir. Özel çalışma veya araştırma amacıyla yapılan adil kullanım dışında, içerik yalnızca bilgi amaçlı sağlanmaktadır.